Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VIPAS39Q9H9C1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIPAS39Q9H9C1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms