Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX2-4Q9H2Z4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX2-4Q9H2Z4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NKX2-4Q9H2Z4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX2-4Q9H2Z4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-4Q9H2Z4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-4Q9H2Z4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.7 ms