Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC113Q9H0I3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC113Q9H0I3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms