Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSD3Q9BZ95 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NSD3Q9BZ95 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NSD3Q9BZ95 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NSD3Q9BZ95 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms