Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM34Q9BYJ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM34Q9BYJ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms