Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG6Q9BXT2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG6Q9BXT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG6Q9BXT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG6Q9BXT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG6Q9BXT2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG6Q9BXT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG6Q9BXT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNG6Q9BXT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNG6Q9BXT2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms