Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC106Q9BWC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC106Q9BWC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms