Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TMED9Q9BVK6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMED9Q9BVK6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms