Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAAF1Q9BRP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PAAF1Q9BRP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAAF1Q9BRP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAAF1Q9BRP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms