Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PRRT1Q99946 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT1Q99946 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms