Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYD88Q99836 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MYD88Q99836 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MYD88Q99836 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MYD88Q99836 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms