Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY1Q96T51 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY1Q96T51 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY1Q96T51 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms