Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAL3ST4Q96RP7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAL3ST4Q96RP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GAL3ST4Q96RP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms