Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAL3ST4Q96RP7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAL3ST4Q96RP7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAL3ST4Q96RP7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GAL3ST4Q96RP7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GAL3ST4Q96RP7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GAL3ST4Q96RP7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GAL3ST4Q96RP7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAL3ST4Q96RP7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAL3ST4Q96RP7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GAL3ST4Q96RP7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAL3ST4Q96RP7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GAL3ST4Q96RP7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GAL3ST4Q96RP7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GAL3ST4Q96RP7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAL3ST4Q96RP7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAL3ST4Q96RP7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAL3ST4Q96RP7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GAL3ST4Q96RP7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAL3ST4Q96RP7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAL3ST4Q96RP7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GAL3ST4Q96RP7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GAL3ST4Q96RP7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GAL3ST4Q96RP7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GAL3ST4Q96RP7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAL3ST4Q96RP7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAL3ST4Q96RP7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAL3ST4Q96RP7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAL3ST4Q96RP7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GAL3ST4Q96RP7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GAL3ST4Q96RP7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GAL3ST4Q96RP7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GAL3ST4Q96RP7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAL3ST4Q96RP7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GAL3ST4Q96RP7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GAL3ST4Q96RP7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GAL3ST4Q96RP7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAL3ST4Q96RP7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAL3ST4Q96RP7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAL3ST4Q96RP7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAL3ST4Q96RP7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GAL3ST4Q96RP7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAL3ST4Q96RP7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GAL3ST4Q96RP7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GAL3ST4Q96RP7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAL3ST4Q96RP7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GAL3ST4Q96RP7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GAL3ST4Q96RP7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAL3ST4Q96RP7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAL3ST4Q96RP7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAL3ST4Q96RP7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GAL3ST4Q96RP7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GAL3ST4Q96RP7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GAL3ST4Q96RP7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAL3ST4Q96RP7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAL3ST4Q96RP7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAL3ST4Q96RP7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAL3ST4Q96RP7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAL3ST4Q96RP7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GAL3ST4Q96RP7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAL3ST4Q96RP7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GAL3ST4Q96RP7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAL3ST4Q96RP7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAL3ST4Q96RP7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAL3ST4Q96RP7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAL3ST4Q96RP7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GAL3ST4Q96RP7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAL3ST4Q96RP7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GAL3ST4Q96RP7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAL3ST4Q96RP7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAL3ST4Q96RP7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GAL3ST4Q96RP7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GAL3ST4Q96RP7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GAL3ST4Q96RP7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GAL3ST4Q96RP7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GAL3ST4Q96RP7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAL3ST4Q96RP7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GAL3ST4Q96RP7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GAL3ST4Q96RP7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAL3ST4Q96RP7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAL3ST4Q96RP7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GAL3ST4Q96RP7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAL3ST4Q96RP7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAL3ST4Q96RP7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAL3ST4Q96RP7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GAL3ST4Q96RP7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAL3ST4Q96RP7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GAL3ST4Q96RP7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GAL3ST4Q96RP7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GAL3ST4Q96RP7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GAL3ST4Q96RP7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAL3ST4Q96RP7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAL3ST4Q96RP7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAL3ST4Q96RP7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GAL3ST4Q96RP7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAL3ST4Q96RP7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAL3ST4Q96RP7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GAL3ST4Q96RP7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GAL3ST4Q96RP7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAL3ST4Q96RP7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms