Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2CR12Q96Q35 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2CR12Q96Q35 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms