Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SORCS2Q96PQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SORCS2Q96PQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms