Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPNS2Q96L46 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CAPNS2Q96L46 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPNS2Q96L46 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPNS2Q96L46 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPNS2Q96L46 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms