Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD3Q96L08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD3Q96L08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD3Q96L08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms