Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN37Q96GY3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN37Q96GY3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN37Q96GY3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms