Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMIM12Q96EX1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms