Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGF29Q96ES7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGF29Q96ES7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGF29Q96ES7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms