Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF31Q96EP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF31Q96EP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms