Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39BQ96DA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39BQ96DA2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39BQ96DA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39BQ96DA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39BQ96DA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB39BQ96DA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB39BQ96DA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39BQ96DA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB39BQ96DA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.3 ms