Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC45Q96CN5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC45Q96CN5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms