Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1orf54Q8WWF1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf54Q8WWF1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf54Q8WWF1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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