Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TRIM41Q8WV44 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TRIM41Q8WV44 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
TRIM41Q8WV44 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
TRIM41Q8WV44 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
TRIM41Q8WV44 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms