Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT2Q8TDY3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT2Q8TDY3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT2Q8TDY3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms