Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHD5Q8TDI0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD5Q8TDI0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms