Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEST2Q8NFU1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEST2Q8NFU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms