Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C3orf20Q8ND61 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf20Q8ND61 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf20Q8ND61 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf20Q8ND61 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms