Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA1Q8N8W4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA1Q8N8W4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms