Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C15orf54Q8N8G6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C15orf54Q8N8G6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf54Q8N8G6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf54Q8N8G6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf54Q8N8G6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf54Q8N8G6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf54Q8N8G6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf54Q8N8G6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms