Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNL1Q8IU54 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNL1Q8IU54 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNL1Q8IU54 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNL1Q8IU54 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms