Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR53Q7Z5U6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR53Q7Z5U6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms