Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C16orf54Q6UWD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C16orf54Q6UWD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms