Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf146Q5VVC0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf146Q5VVC0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf146Q5VVC0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms