Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SDHAF4Q5VUM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDHAF4Q5VUM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms