Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39BQ5VTQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39BQ5VTQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC39BQ5VTQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms