Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF19Q5T6S3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF19Q5T6S3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF19Q5T6S3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms