Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2D4BQ5SQS7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms