Protein–RNA interactions for Protein: Q580R0

C2orf27A, Uncharacterized protein C2orf27, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf27AQ580R0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2orf27AQ580R0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf27AQ580R0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2orf27AQ580R0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2orf27AQ580R0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms