Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC44A4Q53GD3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC44A4Q53GD3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A4Q53GD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms