Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTDC1Q4AE62 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTDC1Q4AE62 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms