Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ISXQ2M1V0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ISXQ2M1V0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms