Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDKN3Q16667 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDKN3Q16667 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms