Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIF1AQ16665 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIF1AQ16665 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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