Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC6Q16204 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC6Q16204 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC6Q16204 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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