Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1BQ14684 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP1BQ14684 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1BQ14684 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
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