Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1CQ13936 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1CQ13936 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1CQ13936 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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