Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTAN1Q13813 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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